两年多以前，英国植物学家杰西爱上了美国女人朱蒂，但那时的朱蒂正深陷和自己的前夫争夺儿子小汤姆抚养权的官司。因为输了官司，失去儿子的朱蒂丧失了生活的意志，不忍心看到心爱的人如此沮丧的杰西使用了自己最新的研究成果去帮助朱蒂。小汤姆变成了一个“奇怪的婴儿”，因为包括朱蒂的前夫、保姆等人在内所有接触过小汤姆的人，都开始感觉到全身麻痹，呼吸困难。当这种现象持续一个月以后，朱蒂再去找她的前夫索要孩子抚养权的时候，前夫十分痛快地答应了她的要求。
夺回孩子抚养权的朱蒂十分开心，但小汤姆很快就病了，小汤姆的病需要一大笔钱治疗，否则就会有生命危险，可没有工作的朱蒂并没有经济能力帮助自己的孩子。后来，偷听到杰西与安东尼通话的朱蒂知道了安东尼正在应征一批敢于牺牲的“被试者”参加实验，而且奖金十分丰厚。她就向杰西表示愿意参加“灵计划”的实验。深爱朱蒂的杰西显然不会答应，可朱蒂竟然自己偷偷去找了安东尼，表示自己愿意成为第一批“灵战士”中的一员。安东尼给了朱蒂一笔钱，朱蒂开心地回家看小汤姆，并准备带他去医院治疗，但没想到在自家院子的大树上抱着小汤姆享受入院前的快乐的朱蒂，竟然不小心从树上跌落，这导致了小汤姆的意外身亡。
小汤姆的死让朱蒂受到了巨大的打击，她意志消沉，精神错乱。失去孩子之后，朱蒂被安东尼派去的人带走了。她成为了第一批灵战士的被试者。杰西知道了自己心爱的女人被改造成了恐怖的灵战士之后，和安东尼大发雷霆，甚至以自己退出灵武器的计划为威胁，要安东尼放走朱蒂。那时候，安东尼太需要杰西了，只能被迫答应杰西的要求。虽然免于自相残杀的实验，但朱蒂也已经不再是正常的人类。安东尼要求杰西必须负责监管朱蒂，并不能让她走出化灵动物园半步。
可已经精神错乱的朱蒂经常产生一种幻觉：她的儿子小汤姆能够在她家院子里的那颗大树上一个一个长出来，她坚信自己的儿子没死。可突然有一天，幻境里从树上长出来的儿子却又一个又一个消失了。朱蒂觉得，一定是有人带走了她的儿子，她要把他找回来，再重新挂在大树上。为了能够找来更多的婴儿，朱蒂要求杰西再给她一次组灵武器的程序，到时候，收到婴儿折磨的家长亲戚们，一定会像她前夫一样，选择逃离婴儿，朱蒂就可以借机下手，抱走婴儿了。杰西怎么会答应朱蒂这些疯狂的要求，他不肯再把灵武器的程序让朱蒂使用。朱蒂冲动之下，用匕首杀死了杰西，她不仅偷了杰西的灵武器程序，还有杰西带有‘隐蔽程序’的锆石。
可怕的是，朱蒂把灵武器传递给婴儿之后，在婴儿受体上起作用的灵武器的能量越来越大，婴儿身边的人不再只是简单地感到全身麻痹和呼吸困难，而是如死一样的痛苦。婴儿们在辐射他人过程中，他们的样子也越来越恐怖。朱蒂确实顺利地从各个婴儿的家庭中带走了小婴儿，但她自己也在一次又一次地异化小婴儿的过程中受到组灵服务的辐射。最终，她自己也是个带有“有毒植物”成分的灵生物了。
“虽然杰西和朱蒂的爱情是一场悲剧，但他们的确在我被安东尼囚禁的时候，把我从灵监狱里救了出去。”孔哲表情凝重。
“可他们为什么要救你呢？”应烟诺问道。
“因为杰西知道了朱蒂总是看到婴儿大树的幻觉，他希望我作为精神科医生能帮帮朱蒂。我答应杰西的条件，就是有一天他要帮助我逃离开安东尼的控制。后来，我和朱蒂聊过几次，在我的努力下，她也的确开始接受我和她的谈话了。那时候，我也是第一次尝试给灵生物进行精神治疗。所以杰西和朱蒂，对我算是有些好感，我利用‘隐蔽程序’在朱蒂引开安东尼注意力的时候，成功逃离了化灵动物园。”孔哲讲述着当年的情况。